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Commit f8cd42e2 authored by Giovanni Bussi's avatar Giovanni Bussi
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Regtest 

Some test for the leptonx2 optimization.
Also some test for different functions.
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# this is just to make sure that stretching is correct with the optimized x2 implementation
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DUMPDERIVATIVES ARG=c1,cs1 FILE=deriv1 FMT=%8.4f
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#! FIELDS time c d dfast e f g h
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regtest/basic/rt42/plumed.dat
+ 18
− 0
View file @ f8cd42e2
......@@ -5,3 +5,21 @@ PRINT ARG=c,d FILE=colvar FMT=%8.4f STRIDE=1
FLUSH STRIDE=1
s: COMBINE ARG=c,d PERIODIC=NO
RESTRAINT ARG=s KAPPA=0 SLOPE=1 AT=0
dfast: COORDINATION GROUPA=1-108 GROUPB=1-108 SWITCH={CUSTOM FUNC=1/(1+x2^3) R_0=1}
e: COORDINATION GROUPA=1-108 GROUPB=1-108 R_0=1 NN=7 D_0=0.1
f: COORDINATION GROUPA=1-108 GROUPB=1-108 SWITCH={CUSTOM FUNC=1/(1+x^7) R_0=1 D_0=0.1}
g: COORDINATION GROUPA=1-108 GROUPB=1-108 SWITCH={EXP R_0=1}
h: COORDINATION GROUPA=1-108 GROUPB=1-108 SWITCH={CUSTOM FUNC=exp(-x) R_0=1}
PRINT ARG=c,d,dfast,e,f,g,h FILE=check1 FMT=%8.4f
# this would check derivatives:
# DUMPDERIVATIVES ARG=c,d,dfast FILE=der0 FMT=%8.4f
# DUMPDERIVATIVES ARG=e,f FILE=der1 FMT=%8.4f
# DUMPDERIVATIVES ARG=g,h FILE=der2 FMT=%8.4f
# to detect errors we just add and subtract biases
# this should add zero forces
all: COMBINE ARG=c,d,dfast,e,f,g,h COEFFICIENTS=1,-0.5,-0.5,1,-1,1,-1 PERIODIC=NO
RESTRAINT ARG=all KAPPA=0 SLOPE=0.001 AT=0
# SLOPE is very small in order to avoid numerical errors to appear
# it should be sufficient to detect errors
0% or .
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