Merge branch 'v2.4' into v2.5

regtest/basic/rt-pesmd/Makefile

+include ../../scripts/test.make

regtest/basic/rt-pesmd/colv.reference

+#! FIELDS time d1.x rr.bias rr.force2
+ 0.000000   0.1000   0.0100   0.0400
+ 0.005000   0.0993   0.0099   0.0394
+ 0.010000   0.0987   0.0097   0.0390
+ 0.015000   0.0981   0.0096   0.0385
+ 0.020000   0.0982   0.0097   0.0386
+ 0.025000   0.0984   0.0097   0.0387
+ 0.030000   0.0989   0.0098   0.0392
+ 0.035000   0.0993   0.0099   0.0394
+ 0.040000   0.0996   0.0099   0.0397
+ 0.045000   0.1001   0.0100   0.0401
+ 0.050000   0.1004   0.0101   0.0403
+ 0.055000   0.1008   0.0102   0.0406
+ 0.060000   0.1004   0.0101   0.0403
+ 0.065000   0.0995   0.0099   0.0396
+ 0.070000   0.0988   0.0098   0.0391
+ 0.075000   0.0988   0.0098   0.0390
+ 0.080000   0.0985   0.0097   0.0388
+ 0.085000   0.0984   0.0097   0.0388
+ 0.090000   0.0984   0.0097   0.0387
+ 0.095000   0.0982   0.0096   0.0385
+ 0.100000   0.0978   0.0096   0.0383
+ 0.105000   0.0976   0.0095   0.0381
+ 0.110000   0.0974   0.0095   0.0379
+ 0.115000   0.0968   0.0094   0.0375
+ 0.120000   0.0961   0.0092   0.0369
+ 0.125000   0.0952   0.0091   0.0362
+ 0.130000   0.0934   0.0087   0.0349
+ 0.135000   0.0919   0.0084   0.0338
+ 0.140000   0.0919   0.0084   0.0338
+ 0.145000   0.0928   0.0086   0.0344
+ 0.150000   0.0946   0.0089   0.0358
+ 0.155000   0.0969   0.0094   0.0376
+ 0.160000   0.0994   0.0099   0.0396
+ 0.165000   0.1023   0.0105   0.0419
+ 0.170000   0.1061   0.0112   0.0450
+ 0.175000   0.1084   0.0118   0.0470
+ 0.180000   0.1110   0.0123   0.0493
+ 0.185000   0.1133   0.0128   0.0514
+ 0.190000   0.1151   0.0132   0.0530
+ 0.195000   0.1169   0.0137   0.0547
+ 0.200000   0.1184   0.0140   0.0560
+ 0.205000   0.1207   0.0146   0.0583
+ 0.210000   0.1233   0.0152   0.0608
+ 0.215000   0.1247   0.0155   0.0622
+ 0.220000   0.1259   0.0159   0.0634
+ 0.225000   0.1276   0.0163   0.0651
+ 0.230000   0.1291   0.0167   0.0666
+ 0.235000   0.1301   0.0169   0.0678
+ 0.240000   0.1304   0.0170   0.0680
+ 0.245000   0.1310   0.0172   0.0686
+ 0.250000   0.1312   0.0172   0.0689

regtest/basic/rt-pesmd/config

+type=plumed
+arg="pesmd input.dat" 

regtest/basic/rt-pesmd/input.dat

+temperature 0.1
+friction 0.1
+tstep 0.005
+dimension 1
+nstep 50
+ipos 0.1
+periodic false

regtest/basic/rt-pesmd/plumed.dat

+d1: DISTANCE ATOMS=1,2 COMPONENTS
+rr: RESTRAINT ARG=d1.x AT=0.0 KAPPA=2 
+PRINT ARG=d1.x,rr.* FILE=colv FMT=%8.4f