+ [Purin](#purin)ová [báze](#báze) (C5H5N5); [nukleotid](#nukleotid)y s adeninem (A) se v [DNA](#dna) párují s [thymin](#thymin)em (T). V RNA s [uracil](#uracil)em (U).
+ [Purin](#purin)ová [báze](#báze) (C5H5N5); [nukleotid](#nukleotid)y s adeninem (A) se v [DNA](#DNA) párují s [thymin](#thymin)em (T). V RNA s [uracil](#uracil)em (U).
+ V chemii minimální množství energie, které musí sloučeniny vykazovat, aby mohlo dojít k jejich účasti v chemické reakci. V biochemii je snížení aktivační energie biochemické reakce základním principem fungování [enzym](#enzym)ů.
@@ -41,7 +41,7 @@ output:
+ U organických molekul - obsahující kruhové uspořádání atomů uhlíku .
+ cDNA - zkratka pro "complementary DNA" - [DNA](#dna), která je přirozeně nebo uměle syntetizována reverzní transkriptázou (RT) na základě [templát](#templát)u [RNA](#rna).
+ cDNA - zkratka pro "complementary DNA" - [DNA](#DNA), která je přirozeně nebo uměle syntetizována reverzní transkriptázou (RT) na základě [templát](#templát)u [RNA](#RNA).
+ Popisuje tok genetické informace v rámci organismů. V jednoduchosti "[DNA](#DNA) → [RNA](#RNA) → [protein](#protein)", ve skutečnosti však dovoluje přepis mezi nukleovými kyselinami a překlad z [RNA](#RNA) do [protein](#protein)ů a to má za důsledek nemožnost toku informací z bílkovin do nukleových kyselin.
+ Kovalentní chemicka vazba mezi dvěma sulfhydrilovymi skupinami (-SH), které v proteinech poskytují boční řetězce cysteinu .
### [dna](https://en.wikipedia.org/wiki/DNA)
### [DNA](https://en.wikipedia.org/wiki/DNA)
+ Polymery deoxyribo[nukleotid](#nukleotid)ů důležité pro fungování života na Zemi (zabezpečující schopnost dědičnosti znaků). DNA je organizována párováním bazí do dlouhých antiparalelních spirálovitých dvouvláken tvořících [genom](#genom)y buněk nebo [virové](#virus) částice.
+ Zkratka pro "electron spray ionization", jednu z metod [hmostnostní spektrometrie](hmotnostní_spektrometrie), pomoci které je možné např. určit pořadí [aminokyselin](#aminokyselina) v [protein]()u.
+ Chromatin, který má organizaci umožňující [transkripci](#transkripce) a jiné biochemické aktivity
@@ -156,13 +156,13 @@ output:
+ Technika separace molekul v gelové hmotě (např . agaróze) s pomocí elektrického pole, ve které se separované molekuly pohybují dle svých vlastností , např . velikosti.
### [gen](https://en.wikipedia.org/wiki/Gene)
+ V genetice základní jednotka dědičnosti se specifickým umístěním na [chromosom](#chromosom)u - místo se nazývá [lokus](#lokus). Z hlediska molekulární biologie, gen fyzicky vytváří segment [DNA](#dna) se specifickou, evolucí modelovanou [sekvencí](#sekvence) [nukleotid](#nukleotid)ů.
+ V genetice základní jednotka dědičnosti se specifickým umístěním na [chromosom](#chromosom)u - místo se nazývá [lokus](#lokus). Z hlediska molekulární biologie, gen fyzicky vytváří segment [DNA](#DNA) se specifickou, evolucí modelovanou [sekvencí](#sekvence) [nukleotid](#nukleotid)ů.
+ Soubor pravidel, které se uplatňují v buňce v procesu [translace](#translace) (syntézy [protein](#protein)ů na [ribozom](#ribozom)ech). Tyto pravidla určují jaká [aminokyselina](#aminokyselina) je zařazena do [protein](#protein)u při čtení určitého [kodon](#kodon)u [mRNA](mRNA) [ribozom](#ribozom)em.
### [genom](https://en.wikipedia.org/wiki/Genome)
+ Sada všech [gen](#gen)ů buňky nebo organismu. Lze chápat i jako veškerý genetický materiál buňky - [DNA](#dna).
+ Sada všech [gen](#gen)ů buňky nebo organismu. Lze chápat i jako veškerý genetický materiál buňky - [DNA](#DNA).
+ Konkrétní výbava (kombinace) [gen](#gen)ů daného organismu. Lze použít i na označení variant ([alel](#alela)) jednoho nebo několika [gen](#gen)ů, které jsou v dané chvíli důležité (studovány). Z pohledu klasické genetiky se genotyp projevuje navenek jako pozorovatelný [fenotyp](#fenotyp).
+ Jednovláknová molekula [RNA](#rna) odpovídající [sekvencí](#sekvence) nějakému [gen](#gen)u (ze kterého je [transkribována](#transkripce)) umožňující přenos genetické informace k [ribozom](#ribozom)ům, kde dochází na její základě k syntéze příslušného [protein](#protein)u ([kódovaného](#genetický_kód) danou mRNA).
+ Jednovláknová molekula [RNA](#RNA) odpovídající [sekvencí](#sekvence) nějakému [gen](#gen)u (ze kterého je [transkribována](#transkripce)) umožňující přenos genetické informace k [ribozom](#ribozom)ům, kde dochází na její základě k syntéze příslušného [protein](#protein)u ([kódovaného](#genetický_kód) danou mRNA).
+ Organická sloučenina pozůstavající z fosforylovaného cukru (typicky [ribózy](#ribóza)) a dusíkaté [báze](#báze). Představuje základní stavební jednotku [DNA](#dna) a [RNA](#rna).
+ Organická sloučenina pozůstavající z fosforylovaného cukru (typicky [ribózy](#ribóza)) a dusíkaté [báze](#báze). Představuje základní stavební jednotku [DNA](#DNA) a [RNA](#RNA).
+ Část [makromolekuly](#makromolekula), která postupně prochází všemi [c-alfa uhlík](#c-alfa_uhlík)y a [peptidickými vazbami](#peptidická_vazba) mezi [aminokyselina](#aminokyselina)mi [protein](#protein)u.
+ Zkratka pro "polymerase chain reaction" - metoda syntézy určité oblasti [DNA](#dna) ([amplifikace](#amplifikace)) s využitím [DNA polymerázy](#dna_polymeráza) [in vitro](#in_vitro).
+ Zkratka pro "polymerase chain reaction" - metoda syntézy určité oblasti [DNA](#DNA) ([amplifikace](#amplifikace)) s využitím [DNA polymerázy](#DNA_polymeráza) [in vitro](#in_vitro).
+ Polymer ribo[nukleotid](#nukleotid)ů, vláknitá molekula důležitá pro vznik a funkci života na Zemi, vzniká [transkripcí](#transkripce) (přepisem) vzorové sekvence [nukleotid](#nukleotid)ů ([gen](#gen)u) příslušného úseku [DNA](#rna).
### [RNA](https://en.wikipedia.org/wiki/RNA)
+ Polymer ribo[nukleotid](#nukleotid)ů, vláknitá molekula důležitá pro vznik a funkci života na Zemi, vzniká [transkripcí](#transkripce) (přepisem) vzorové sekvence [nukleotid](#nukleotid)ů ([gen](#gen)u) příslušného úseku [DNA](#DNA).
+ [Kodon](#kodon) označující začátek [translace](#translace). Je to první [mRNA](#mrna) [kodon](#kodon), který je překládaný [ribozom](#ribozom)em. U eukaryotů vždycky kóduje methionin protože iniciace translace používá zvláštní tRNA. Nejběžneji se taky jedná o kodon methioninu AUG.
+ [Kodon](#kodon) označující začátek [translace](#translace). Je to první [mRNA](#mRNA) [kodon](#kodon), který je překládaný [ribozom](#ribozom)em. U eukaryotů vždycky kóduje methionin protože iniciace translace používá zvláštní tRNA. Nejběžneji se taky jedná o kodon methioninu AUG.
+ U proteinů situace, kdy modelování nebo změna konformace by vyžadovala kolizi (či dokonce překrytí) dvou částí makromolekuly v prostoru. Mezí takových změn konformace jsou Van der Waalsovy poloměry atomů.
+ Konec [DNA](#dna) molekuly, přičemž jedno vlákno [DNA](#dna) je delší než to druhé, teda existují na jeho konci nespárované nukleotidy. Jeho opakem je [blunt end](#"blunt end"). Nejčastěji vznikají tehdy, když [restrikční endonukleáza](#restrikcni-endonukleaza) rozdělí dvouzávitnicovou DNA v jednotlivých vláknech na rozdílných místech. Vznikne tak něco, co se v angličtine označuje *overhang* (do češtiny to můžeme přeložit jako *převis*). <br />
+ Konec [DNA](#DNA) molekuly, přičemž jedno vlákno [DNA](#DNA) je delší než to druhé, teda existují na jeho konci nespárované nukleotidy. Jeho opakem je [blunt end](#"blunt end"). Nejčastěji vznikají tehdy, když [restrikční endonukleáza](#restrikcni-endonukleaza) rozdělí dvouzávitnicovou DNA v jednotlivých vláknech na rozdílných místech. Vznikne tak něco, co se v angličtine označuje *overhang* (do češtiny to můžeme přeložit jako *převis*). <br />
+ Triplet nukleotidů v [mRNA](#mrna), signalizující ukončení [translace](#translace) proteinu. Tyto nukleotidy [ribozómom](#ribozom) nedávají instrukci ke vložení specifické [aminokyseliny](#aminokyselina), ale zapřičiňují konec [translace](#translace). Obvykle je to jeden z [kodonů](#kodon) UAA, UAG nebo UGA.
+ Triplet nukleotidů v [mRNA](#mRNA), signalizující ukončení [translace](#translace) proteinu. Tyto nukleotidy [ribozómom](#ribozom) nedávají instrukci ke vložení specifické [aminokyseliny](#aminokyselina), ale zapřičiňují konec [translace](#translace). Obvykle je to jeden z [kodonů](#kodon) UAA, UAG nebo UGA.
+ Strukturní proteiny propůjčují jinak tekutým biologickým komponentům tuhost a pevnost. Mezi známé proteiny z této kategorie patří kolagen, elastin, keratin, nebo také myosin.
+ Část promoteru [DNA](#dna) sekvencie eukaryotů, dle které je možné rozlišit začátek [transkripce](#transkripce) ([downstream](#downstream) od [TATA boxu](#TATA box)). Jméno je určeno dle výskytu opakujících se bází [A](#adenin) a [T](#tymin).
+ Část promoteru [DNA](#DNA) sekvencie eukaryotů, dle které je možné rozlišit začátek [transkripce](#transkripce) ([downstream](#downstream) od [TATA boxu](#TATA box)). Jméno je určeno dle výskytu opakujících se bází [A](#adenin) a [T](#tymin).
+ Topologie [proteinu](#protein) je zjednodušený popis jeho poskládání obsahující pouze sekvenci [sekudárních struktu](#sekundární struktura) a jejich relativní polohu v prostoru a přibližnou orientaci.
+ Odkazuje na relativní pozici v [sekvenci DNA/RNA](#sekvence DNA/RNA) vzhledem ke [gen](#gen)u, případně jiné sekvenční struktuře. V molekule [RNA](#RNA) to znamená směrem ke 5' konci. V molekule [DNA](#DNA) to znamená směrem ke 5' konci kódujícího vlákna pro dotyčný [gen](#gen), avšak vzhledem k antiparalelní povaze [DNA](#DNA) to na nekódujícím vláknu znamená směrem ke 3' konci.
